De verschillen zijn eigenlijk niet zo groot. Ook bij het behandelen van problemen met het bewegingsapparaat zijn er meer wegen die naar Rome leiden. Het gaat in feite om twee methoden die hetzelfde willen bereiken, namelijk een gewrichtensysteem (bijvoorbeeld de onderrug) dat los is, recht staat en goed kan functioneren.
Orthomanipulatie benadert het probleem in eerste instantie via veranderingen in de stand van de botdelen. Bij manipulatie wordt eerst gekeken naar de manier waarop het gewricht kan bewegen en functioneert.
Dat brengt met zich mee dat de twee technieken een eigen manier van behandelen hebben: bij orthomanipulatie wordt de stand gecorrigeerd, waarna de functie verbetert. Bij manipulatie wordt de functie gecorrigeerd waardoor de stand verbetert.
